Kroz sustav bonusa organizacija ima priliku motivirati zaposlenike i slati snažnu poruku koja su ponašanja poželjna u organizaciji jer doprinose uspješnosti poduzeća. Pri tom su transparentnost oko kriterija i mogućnosti utjecaja na iznos nagrade ključni za prihvaćanje sustava od strane zaposlenika. Osim sustava plaća i bonusa, organizacija mora razmotriti i ostale materijalne i nematerijane nagrade i upravljati njihovom raspodjelom kako bi postigla što veću motiviranost zaposlenika.